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| Registros recuperados : 42 | |
| 6. |  | RODRÍGUEZ, S.; SILVA, P.; BENTANCOR, O.; GAMBA, F.; PRITSCH, C. Diversidad en las respuestas de defensa a Cochliobulus sativus en cuatro genotipos de cebada. In: JORNADA BIANUAL DE FITOPATOLOGÍA, 2., 2012, Montevideo, UY. Impacto de la intensificación de los cultivos en el desarrollo de las enfermedades: pósters inéditos. Montevideo: SUFIT, 2012. p. 31.| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 7. | | LÓPEZ, L.; RODRIGUEZ, P.; CABRERA, D.; PRITSCH, C.; DINI, M. Diversidad fenotípica del "guayabo del país" en el jardín de introducción en INIA Las Brujas. [Presentación oral]. Módulo 1. Recursos genéticos. Presentaciones Orales. In: Dini, M.; Speroni, G. (Eds.). Encuentro Nacional sobre Frutos Nativos, 11°. Universidad Tecnológica (UTEC), Durazno, Uruguay, 4 y 5 abril 2024, Libro de resúmenes. Canelones (UY): INIA, 2024. p.7. (Serie Actividades de Difusión; 804) Agradecimientos: Agencia Nacional de Investigación e Innovación.| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 9. | | BARAIBAR, S.; SILVA, P.; PRITSCH, C.; GERMAN, S. Transfiriendo combinaciones de genes de resistencia a roya de tallo a background de trigo adaptado al Uruguay. MV 8 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 284| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 10. | | BARAIBAR, S.; SILVA, P.; PRITSCH, C.; GERMAN, S. Transfiriendo combinaciones de genes de resistencia a roya de tallo a background de trigo adaptado al Uruguay. [p18*]. Bloque 2: Mejoramiento por resistencia a enfermedades. In: Sociedad Uruguaya de Fitopatología Jornada Uruguaya de Fitopatología, 4., Jornada Uruguaya de Protección Vegetal, 2., 1° setiembre, 2017, Montevideo, Uruguay. Libro de resúmenes. Montevideo (UY): Sociedad Uruguay de Fitopatología (SUFIT), 2017. p. 38. [p18*]: *Trabajo ya presentado en el XVI Congreso Latinoamericano de Genética, Uruguay.
Financiamiento: Proyecto INNOVAGRO FSA_1_2013_1_12980, ANII.| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 11. | | ROSTAGNOL, G.; AGUERRE, S.; ÁLVAREZ, M.; MACHADO, G.; CABRERA, D.; VIGNALE, B.; PRITSCH, C.; QUEZADA, M. Caracterización fenotípica de dos poblaciones de mejoramiento de Guayabo del país (Acca sellowiana, Berg. Burret). In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Frutícola. Encuentro Nacional sobre Frutos Nativos, 9°. Fiesta Nacional del Guayabo del País, 1. Centro de Recreación de Paso Severino, Florida; 28-29 de marzo de 2019. Canelones (Uruguay): INIA. p. 8. (Serie Actividades de Difusión; 789).| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 13. | | QUEZADA, M.; AMADEU, R. R.; VIGNALE, B.; CABRERA, D.; PRITSCH, C.; GARCIA, A. A. F. Construction of a high-density genetic map of Acca sellowiana (Berg.) Burret, an outcrossing species, based on two connected mapping populations. Original Research Article. Frontiers in Plant Science, 23 February 2021, Volume 12, Article number 626811. OPEN ACCESS. Doi: https://doi.org/10.3389/fpls.2021.626811 Article history: Received: 06 November 2020; Accepted: 12 January 2021; Published: 23 February 2021.
Edited by: Maria Luisa Badenes, Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Spain.
Reviewed by: Shouvik Das, Indian Agricultural...| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 14. | | BARAIBAR, S.; SILVA, P.; PRITSCH, C.; RAFFO, M.A.; PEREYRA, S.; GERMAN, S. Development of adapted wheat lines resistant to Ug99+ with combinations of Sr26, Sr32 and Sr39. [Poster]. In: Proceedings of the Borlaug Global Rust Initiative Technical Workshop ,14-18 April, 2018, Marrakesh, Marruecos.| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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| 15. | | UMAÑA, R.; PRITSCH, C.; ARBIZA, J.R.; RIVAS, F.; PAGLIANO, G. Evaluation of four viroid rna extraction methods for the molecular diagnosis of cevd in citrus lemon using rt-pcr, dot blot and northern blot. [Evaluación de cuatro métodos de extracción de ARN viroide para el diagnóstico molecular de CEVd en Citrus limon mediante RT-PCR, Dot blot y Northern blot.]. Biotecnologia Aplicada, 2013, v.30, no.2, p.125-130. 2-s2.0-84884171392 1027-2852| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 16. | | BACCINO, E.; QUEZADA, M.; BACCINO, M.; RIVAS, M.; PUPPO, M.; PRITSCH, C. Estructura genética de cuatro poblaciones silvestres de Acca Sellowiana (Berg.) Burret (Guayabo del país). In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Frutícola; Facultad de Agronomía, Universidad de la República; Dirección General Forestal, MGAP. Encuentro Nacional de Frutos Nativos, 5. Salto (Uruguay): INIA, 2010. p. 11 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 602)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 17. | | PAGLIANO, G.; UMANA, R.; PRITSCH, C.; RIVAS, F.; DURÁN-VILA, N. Occurrence, prevalence and distribution of Citrus viroids in Uruguay. [Short communication]. Journal of Plant Pathology, 2013, v.95, no.3, p.631-635.| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 18. | | NARANCIO, R.; ZORRILLA, P.; ROBELLO, C.; GONZÁLEZ-ARCOS, M.; VILARÓ, F.; PRITSCH, C.; DALLA RIZZA, M. Insights on gene expression response of a characterized resistant genotype of Solanum commersonii Dun. against Ralstonia solanacearum. European Journal of Plant Pathology, 2013, v.136, no.4, p.823-835. Article history: Accepted: 27 March 2013 / Published online: 28 April 2013.| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 19. | | QUEZADA, M.; PRITSCH, C.; VIGNALE, B.; CABRERA, D.; GARCÍA, A.A.F. Primer reporte de la construcción de un mapa genético en Acca sellowiana (Berg.) Burret empleando genotyping by sequencing. MV 38 - COMUNICACIONES LIBRES - MV. MEJORAMIENTO VEGETAL In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 299| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 20. | | SOUZA-PÉREZ, M; VAIO, M.; PRITSCH, C.; HORMAZA, I.; SPERONI, G. De tal palo tal semilla. Apomixis en poblaciones silvestres de arazá. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); Programa Nacional Producción Frutícola. Encuentro Nacional sobre Frutos Nativos, 10°. Encuentro virtual 13 y 14 de mayo de 2021. Canelones (Uruguay): INIA. p.15-18. (Serie Actividades de Difusión; 797) Este resumen consiste en la presentación de avances de uno de los capítulos de la tesis de doctorado de Mercedes Souza-Pérez titulada ?Identidad de células reproductivas e incidencia de la apomixis en poblaciones silvestres de Psidium...| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| Registros recuperados : 42 | |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha actual : |
04/10/2014 |
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Actualizado : |
06/06/2023 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Circulación / Nivel : |
B - 5 |
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Autor : |
UMAÑA, R.; PRITSCH, C.; ARBIZA, J.R.; RIVAS, F.; PAGLIANO, G. |
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Afiliación : |
CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
Evaluation of four viroid rna extraction methods for the molecular diagnosis of cevd in citrus lemon using rt-pcr, dot blot and northern blot. [Evaluación de cuatro métodos de extracción de ARN viroide para el diagnóstico molecular de CEVd en Citrus limon mediante RT-PCR, Dot blot y Northern blot.]. |
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Fecha de publicación : |
2013 |
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Fuente / Imprenta : |
Biotecnologia Aplicada, 2013, v.30, no.2, p.125-130. |
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Descripción física : |
2-s2.0-84884171392 |
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Serie : |
1027-2852 |
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ISSN : |
1027-2852 |
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Idioma : |
Inglés |
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Contenido : |
ABSTRACT.
An efficient method for RNA extraction that leads to RNA high yield and purity is a technical issue relevant for development and optimization of molecular diagnostic methods aimed to detect viroid infections in citrus varieties. Residual contaminants may affect RNA detection depending on the molecular diagnosis approaches. This condition can be evaluated through RNA absorption spectrum analysis. Functionally, it is assessed through observation of RTPCR amplification products and Northern blot and Dot-blot signal intensities, displaying levels of analytical response/ sensitivity. Four RNA extraction methods were evaluated to determine their effects on the capacity to detect viroid CEVd presence/absence in Citrus limon through four molecular diagnostic approaches: 1) conventional viroid extraction (CVE); 2) phenol/guanidine thiocyanate (PGT), 3) SDS/potassium acetate (SPA); and 4) formaldehyde/ SSC (FS). Phloem tissue quantifications showed values between 7500 ng/μL and 1200 ng/μL and ranged 1.3-2.0 OD260/280. Evaluations through RT-PCR showed the expected amplifications of the entire CEVd genome, but erratic scenarios still remained. Non-radioactive probe hybridization techniques revealed high intensity signals (132 RU) for infected tissue, by using the CVE method, and a positivity cut-off for the presence of infection was established (78 RU). Nevertheless, molecular hybridization tools can jeopardize the diagnosis due to the thoroughness of the protocol and the RNA template conditions. The diagnostic ability of the association of Northern blot with CVE viroid extraction
analyses as starting point was evidenced for successful detection, among the molecular methods tested.
RESUMEN.Evaluación de cuatro métodos de extracción de ARN viroide para el diagnóstico molecular de CEVd en Citrus limon mediante RT-PCR, Dot blot y Northern blot. En el desarrollo de metodologías moleculares diagnósticas en variedades cítricas propensas a infección viroide, se precisa la extracción efi ciente de ARN, siguiendo criterios de concentración y pureza. Los contaminantes remanentes pueden afectar la detección según la herramienta molecular escogida. Esta condición se analiza a partir del espectro de absorción del ARN; mediante la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) y por los niveles de intensidad de las señales de Northern blot y Dot blot, en términos de respuesta analítica/sensibilidad. Se evaluaron cuatro métodos de extracción de ARN, por sus
efectos sobre la detección de presencia/ausencia del Citrus Exocortis Viroid (CEVd) en Citrus limon mediante análisis moleculares diagnósticos: 1) extracción viroide convencional (EVC); 2) fenol/tiocianato de guanidina (FTG); 3) SDS/ acetato de potasio (SAP); y 4) formaldehído/SSC (FS). Los valores del tejido de fl oema estuvieron entre 7500 ng/μL y 1200 ng/μL y los rangos entre 1.3 y 2.0 DO260/280. La evaluación por aproximaciones de la RT-PCR reflejó las amplifi caciones esperadas del genoma completo del CEVd; sin embargo, aún se discuten los escenarios erráticos.
Las hibridaciones no radiactivas revelaron señales de alta intensidad (132 UR) para el tejido infectado, según el método de EVC, y la defi nición del límite de positividad para la presencia de infección (78 UR). Las herramientas basadas en hibridaciones moleculares interfi eren en el diagnóstico, por la rigurosidad del protocolo y las condiciones del ARN molde. La extracción viroide como punto de partida de una detección exitosa y los métodos moleculares ensayados, mostraron las posibilidades diagnósticas de la asociación de Northern blot con la EVC. MenosABSTRACT.
An efficient method for RNA extraction that leads to RNA high yield and purity is a technical issue relevant for development and optimization of molecular diagnostic methods aimed to detect viroid infections in citrus varieties. Residual contaminants may affect RNA detection depending on the molecular diagnosis approaches. This condition can be evaluated through RNA absorption spectrum analysis. Functionally, it is assessed through observation of RTPCR amplification products and Northern blot and Dot-blot signal intensities, displaying levels of analytical response/ sensitivity. Four RNA extraction methods were evaluated to determine their effects on the capacity to detect viroid CEVd presence/absence in Citrus limon through four molecular diagnostic approaches: 1) conventional viroid extraction (CVE); 2) phenol/guanidine thiocyanate (PGT), 3) SDS/potassium acetate (SPA); and 4) formaldehyde/ SSC (FS). Phloem tissue quantifications showed values between 7500 ng/μL and 1200 ng/μL and ranged 1.3-2.0 OD260/280. Evaluations through RT-PCR showed the expected amplifications of the entire CEVd genome, but erratic scenarios still remained. Non-radioactive probe hybridization techniques revealed high intensity signals (132 RU) for infected tissue, by using the CVE method, and a positivity cut-off for the presence of infection was established (78 RU). Nevertheless, molecular hybridization tools can jeopardize the diagnosis due to the thoroughness of the protocol ... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
CEVd. |
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Thesagro : |
CITRUS; DETECCIÓN DE VIROIDES DE CITRUS; DIAGNOSTICO; ENFERMEDADES DE LOS CITRUS; TECNICAS; VIROSIS. |
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Asunto categoría : |
--
H20 Enfermedades de las plantas |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/3438/1/Rivas-F.-2013.-Biotec.Aplicada-v.302-p.125-130.pdf
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/3439/1/Rivas-F.-2013.-Biotec.Aplicada-v.302-p.131-136.pdf
http://www.medigraphic.com/pdfs/biotecapl/ba-2013/ba132g.pdf
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Marc : |
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650 $aCITRUS
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